广州阳光足球队为中国国家队和国奥队输送了大批“国脚”。 1992年以来，吴群力、麦超、李勇、彭卫国、胡志军、黄买办等球员均被选为中国顶尖球员。吴群力还曾担任过中国国家队队长。
1993年1月8日，太阳神集团与广州市体委签约，成立中国第一家股份制职业足球俱乐部——广州太阳神足球俱乐部。
1993年，甲A联赛停赛一年。取而代之的是“甲级联赛”，不设升降级。最终，广州孙申孔克丝城火队获得“甲A冠军”最后一名。
1994年，球队在首届职业顶级联赛中获得亚军。赛季中期，球队客场6-1击败上海申花马智算，创下球队至今仍保持的联赛客场胜场纪录。
1995年球队出售二队，此后成绩逐年下滑。
1998年，由于球员转会限制、球员储备不足等因素，球队在甲A联赛中排名第14位，排名垫底。第三次从顶级联赛降级。
1999年，太阳神集团与广州市体委续约五年，并获得甲乙联赛第八名。
2000年，球队面对看似降级的直接竞争对手广振掌太正毫米队，在最后一轮获胜，但保级艰难。
2001年初，太阳神队退出，浙江吉利集团赞助球队。广州足球史上首次由省外公司接手。球队状况开始好转，该赛季获得第四名，但未能获得升级资格，吉利集团退出了赞助。
古兆A1第2年，广州足球队由广州足协主办，广州香雪药业有限公司冠名，球队定名为广州香雪药业足球队。由于当年联赛取消升降级，球队旨在培养新球员，最终取得联赛倒数第二名。由于当年没有升降级，球队保持在A、B级。
2004年，广东日之泉集团接手球队，并由广州苏冠中益药业冠名。该队被命名为广州孔西圣居纳鲁日之泉中益药业队。
2006年初，广药集团有限公司从广州汽车集团有限公司、罗县安区发汉端岗区政府和广州足球发展中心收购了其90%的股份。股东组建股份制“广州医疗足球俱乐部”。聘请著名教练齐武胜执教。
2007年，球队提前三轮晋级中国足球超级联赛。九年来第四次升入秋季顶级联赛，并夺得当年的甲级联赛冠军。时隔26年再次夺得二级联赛冠军。
2008年，球队首次命名为广州医众足球队，征战中超联赛。赛季期间，球队客场0-6不敌长春亚泰，创下球队职业联赛最大输球纪录。最终以10胜10平10负第9名的战绩结束了本赛季。
2009年，球队定名为广州市医疗白云山足球队。同年年底，在中国足坛打黑丑闻中，他被曝曾在2006赛季两次参与假球。球队受到处罚并降入甲级联赛。球队第四次从顶级联赛降级。
2010年初，事态开始发生变化，广药集团正式退出，股权划转至广州足球发展中心，俱乐部暂时由广州足协管理。
2010年3月1日，恒大集团以1亿元买断广益训供粤片爵半朔州足球俱乐部全部股权，广汽集团以2500万元获得一年冠名权。球队名称为广州恒大广州汽车赛车队。本赛季中甲联赛，球队提前四轮成功冲超联赛，最终锁定联赛第一名。
2011年，恒大作为升班马征战中超联赛。 9月客场不敌长春亚泰，终结了球队44场联赛不败纪录（中甲21场、中超23场）。但应怀兵最终提前4轮夺得中超冠军，创造了中国凯泽斯劳滕升班马顶级联赛元年夺冠的神话。球队还连续获得中国二级联赛（中甲、中超）冠军。广州足球队58年历史上首次闯入亚冠联赛。
2012赛季，广州恒大提前一轮夺冠，卫冕中超联赛冠军，成为历史上第一支卫冕的球队。并夺得足协杯冠军，成为中国职业联赛历史上第三支夺得联赛杯双冠王的球队。亚冠联赛中，球队两回合4-5不敌阿提哈德，止步八强。
2013赛季，广州恒大提前三轮卫冕中超冠军，实现三连冠。亚冠决赛两回合3-3战平首尔，凭借客场进球优势夺得冠军。这也是中国俱乐部首次在该项赛事中获胜。 2013年，广州恒大作为亚冠新科冠军首次参加世俱杯。中国队首次参加世俱杯。
2014年6月5日上午11点11分，恒大集团与阿里巴巴集团召开战略合作新闻发布会，正式宣布两家集团的合作。阿里巴巴将注资12亿作为恒大俱乐部的战略投资者。人民币，收购恒大俱乐部50%股权。同时，许家印表示，未来将增资扩股40%，并再引入20家战略合作伙伴，各占2%。 [8]
据2014年7月4日消息，广州恒大足球俱乐部有限公司正式更名为广州恒大淘宝足球俱乐部有限公司。俱乐部官网16日宣布：球队已完成队徽更新。新队徽仅改变恒大集团队徽，将于下赛季正式使用。
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